新世代中性子構造生物学の開拓
研究成果
原著論文
- A. Okuda, M. Shimizu, Rintaro Inoue, Reiko Urade, Masaaki Sugiyama,
"Efficient Multiple Domain Ligation for Proteins using Asparaginyl Endopeptidase by Selection of Appropriate Ligation Sites Based on Steric Hindrance",
Angewandte Chemie, (2022).
https://doi.org/10.1002/anie.202214412
- Y. Yunoki, A. Matsumoto, K. Morishima, A. Martel, L. Porcar, N. Sato, R. Yogo, T. Tominaga, R. Inoue, M. Yagi-Utsumi, A. Okuda, M. Shimizu, R. Urade, K. Terauchi, H. Kono, H. Yagi, K. Kato, M. Sugiyama,
"Overall structure of fully assembled cyanobacterial KaiABC circadian clock complex by an integrated experimental-computational approach",
Communications Biology 5 (2022) 184.
https://doi.org/10.1038/s42003-022-03143-z
- H. Nakagawa, T. Saio, M. Nagao, R. Inoue, M. Sugiyama, S. Ajito, T. Tominaga, Y. Kawakita,
"Conformational dynamics of a multidomain protein by neutron scattering and computational analysis",
Biophysical Journal, 120 (2021) 3341-3354.
https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.07.001
- A. Okuda, M. Shimizu, K. Morishima, R. Inoue, N. Sato , R. Urade, M. Sugiyama,
"Solution structure of multi-domain protein ER-60 studied by aggregation-free SAXS and coarse-grained-‑MD simulation",
Scientific Reports,11 (2021) 5655.
doi.org/10.1038/s41598-021-85219-0
- A. Okuda, R. Inoue, K. Morishima, T. Saio, Y. Yunoki, M. Yagi-Utsumi, H. Yagi, M. Shimizu, N. Sato , R. Urade, K. Kato, M. Sugiyama,
"Deuteration Aiming for Neutron Scattering",
Biophysics and Physicobiology,18 (2021) 16-27.
doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v18.003
‡: equal contribution
- R. Inoue, Y. Sakamaki, T. Takata, K. Wood, K. Morishima, N. Sato, A. Okuda, R. Urade, N. Fujii, M. Sugiyama,
"Elucidation of the mechanism of subunit exchange in aB-crystallin oligomers",
Scientific Reports,11 (2021) 2555.
doi.org/10.1038/s41598-021-82250-z
- N. Sato , R. Yogo, S. Yanaka, A, Martel, L.Porcar, K. Morishima, R. Inoue, T. Tominaga, T. Aritomi, J. Takagi, M. Sugiyama, K. Kato,
"A feasibility study of inverse contrast-matching small-angle scattering method combined with size exclusion chromatography using antibody interactions as model systems",
Journal of Biochemistry, 169 (2021) 701-708.
doi.org/10.1093/jb/mvab012
‡: equal contribution
- R. Inoue, T. Oda, H. Nakagawa, T. Tominaga, T. Saio, Y. Kawakita, M. Shimizu, A. Okuda, K. Morishima, N. Sato, R. Urade, M. Sato, M. Sugiyama,
"Dynamics of proteins with different molecular structures under solution condition",
Scientific Reports,10 (2020) 21678.
doi.org/10.1093/jb/mvab012
- H. Nakagawa, Y. Yonetani, K. Nakajima, Seiko Ohira-Kawamura, T Kikuchi, Y. Inamura, M. Kataoka, H. Kono,
"Sequence-dependent hydration water dynamics of dodecameric DNA",
The Proceedings of the 3rd J-PARC Symposium (J-PARC2019).
- T. Tominaga, Y. Kawakita, H. Nakagawa, T. Yamada, K. Shibata,
"Quartz Cell for a Backscattering Spectrometer",
The Proceedings of the 3rd J-PARC Symposium (J-PARC2019).
- T. Yoshizawa, R. Nozawa, Z. J. Jia, T. Saio, E. Mori,
"Biological phase separation: cell biology meets biophysics",
Biophysics Review 12 (2020) 519-539.
doi.org/10.1007/s12551-020-00680-x
- H. Nakagawa, M. Kataoka,
"Rigidity of Protein Structure Revealed by Incoherent Neutron Scattering",
Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 1864 (2020) 129536.
doi.org/10.1016/j.bbagen.2020.129536
- 杉山正明, 井上倫太郎, 中川 洋, 齋尾智英,
"中性子溶液散乱 -現在・過去・未来-",
波紋 30(2) (2020) 16-25.
- 小田隆, 齋尾智英,
"検出技術:天然変性蛋白質の構造生物学",
生物工学, 98(5) (2020).
- R. Charoenwattanasatien, K. Zinzius,M. Scholz, S. Wicke,H. Tanaka, J. S. Brandenburg,G. M. Marchetti, T. Ikegami, T. Matsumoto, T. Oda, M. Sato, M. Hippler, G. Kurisu,
"Calcium sensing via EF-hand 4 enables thioredoxin activity in the sensor-responder protein calredoxin in the green alga Chlamydomonas reinhardtii",
The Journal of biological chemistry, 295 (2020) 170-180.
doi.org/10.1074/jbc.ra119.008735
- M. Oide, T. Kato, T. Oroguchi, M. Nakasako,
"Energy landscape of domain motion in glutamate dehydrogenase deduced from cryo-electron microscopy",
The FEBS Journal, 287 (2020) 3472-3493.
doi.org/10.1111/febs.15224
- A. Fukuda, T. Oroguchi, M. Nakasako,
"Dipole-dipole interactions between tryptophan side chains and hydration water molecules dominate the observed dynamic Stokes shift of lysozyme",
Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1864 (2020) 129406.
doi.org/10.1016/j.bbagen.2019.07.015
- S. Kori, L. Ferry, S. Matano, T. Jimenji, N. Kodera, T. Tsusaka, R. Matsumura, T. Oda, M. Sato, N. Dohmae, T. Ando, Y. Shinkai, P. A. Defossez, K. Arita,
"Structure of the UHRF1 tandem tudor domain bound to a methylated non-histone protein, LIG1,reveals rules for binding and regulation",
Structure 27 (2019) 485-496.
doi.org/10.1016/j.str.2018.11.012
- Y. Yunoki, K. Ishii, M. Yagi-Utsumi, R. Murakami, S. Uchiyama, H. Yagi, K. Kato,
"ATP hydrolysis by KaiC promotes its KaiA binding in the cyanobacterial circadian clock system",
Life Science Alliance 2 (2019) e201900368.
doi.org/10.26508/lsa.201900368
- T. Satoh, M. Yagi-Utsumi, K. Okamoto, E. Kurimoto, K. Tanaka and K. Kato,
"Molecular and structural basis of the proteasome subunit assembly mechanism mediated by the proteasome-assembling chaperone PAC3-PAC4 heterodimer",
International Journal of Molecular Science, 20 (2019) 2231.
doi.org/10.3390/ijms20092231
- M. Yagi-Utsumi,
"NMR characterization of conformational dynamics and molecular assemblies of proteins",
Biological and Pharmaceutical Bulletin 42 (2019) 867-872.
doi.org/10.1248/bpb.b19-00115
- S. G. Itoh, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, H. Okumura,
"Effects of a hydrophilic/hydrophobic interface on amyloid-β peptides studiedbymolecular dynamics simulations andNMR experiments",
Journal of Physical Chemistry B 123 (2019) 160-169.
doi.org/10.1021/acs.jpcb.8b11609
- T. Ekimoto, Y. Kokabu, T. Oroguchi, M. Ikeguchi,
"Combinationofcoarse-grainedmoleculardynamics simulations andsmall-angle X-rayscattering experiments",
Biophysics and Physicobiology 16 (2019) 377-390.
doi.org/10.2142/biophysico.16.0_377
- 齋尾智英,石森浩一郎,
"立体構造から明らかにする分子シャペロンの作用機序",
生物物理 59(4) (2019) 197-201.
- 植草義徳, 加藤晃一, 矢木真穂,
"NMRによる糖鎖 -蛋白質相互作用の解析",
糖鎖分析(日本分析化学会編), 丸善出版, (2019)246-252.
- T. Chatake, Y. Yanagisawa, R. Inoue, M. Sugiyama, T. Matsuo, S. Fujiwara, T. Ohsugi, H. Sumi,
"Purification and structural characterization of water‐soluble menaquinone-7 produced by Bacillus subtilis natto",
Journal of Food Biochemstry 42 (2018) e12630.
doi.org/10.1111/jfbc.12630
- T. Takata, T. Nakamura-Hirota, R. Inoue, K. Morishima, N. Sato, M. Sugiyama, N. Fujii,
"Asp 58 modulates lens αA-crystallin oligomer formation and chaperone function",
The FEBS Journal, 285 (2018) 2263-2277.
doi.org/10.1111/febs.14475
- M. Hirai, S. Ajito, M. Sugiyama, H. Iwase, S. Takata, N. Shimizu, N. Igarashi, A. Martel, L. Porcar,
"Direct Evidence for the Effect of Glycerol on Protein Hydration and Thermal Structural Transition",
Biophysical Journal, 115 (2018) 748.
doi.org/10.1016/j.bpj.2018.06.005
- I. Hayashi, T. Oda, M. Sato, S. Fuchigami,
"Cooperative DNA binding of the plasmid partitioning protein TubR from the Bacillus cereus pXO1 plasmid",
Journal of Molecular Biology 430 (2018) 5015-5028.
doi.org/10.1016/j.jmb.2018.11.001
- S. Yanaka, H. Yagi, R. Yogo, M. Yagi-Utsumi and K. Kato,
"Stable isotope labeling approaches for NMR characterization of glycoproteins using eukaryotic expression systems",
Journal of Biomolecular NMR 71 (2018) 193-202.
doi.org/10.1007/s10858-018-0169-2
- M. Oide, K. Okajima, H. Nakagami, T. Kato, Y. Sekiguchi, T. Oroguchi, T. Hikima, M. Yamamoto, M. Nakasako,
"Blue light-excited LOV1 and LOV2 domains cooperatively regulate the kinase activity of full-length phototrophin2 from arabidopsis",
Journal of Biological Chemistry 293 (2018) 963-972.
doi.org/10.1074/jbc.ra117.000324
- M. Oide, Y. Sekiguchi, A. Fukuda, K. Okajima, T. Oroguchi, M. Nakasako,
"Classification of ab inintio models of proteins restored from small-angle X-ray scattering",
The Journal of Synchrotron Radiation, 25 (2018) 1379-1388.
doi.org/10.1107/S1600577518010342
-
K. Morishima, A. Okuda, R. Inoue, N. Sato, Y. Miyamoto, R. Urade, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, R. Hirano, T. Kujirai, H. Kurumizaka, M. Sugiyama,
"Integral approach to biomacromolecular structure by analytical-ultracentrifugation and small-angle scattering".
Communications Biology, 3, (2020) 294.
doi.org/10.1038/s42003-020-1011-4
- Press release from Kyoto univ.
- Newspaper article (Nikkei)
- A. Okuda, M. Matsusaki, T. Masuda, K. Morishima, N. Sato, R. Inoue, M. Sugiyama, R. Urade,
“A novel soybean protein disulfide isomerase family protein possesses dithiol oxidation activity: Identification and characterization of GmPDIL6”
Journal of Biochemistry,
doi.org/10.1093/jb/mvaa058
- A. Matsumoto‡, M. Sugiyama‡*, Z. Li, A. Martel, L. Porcar, R. Inoue, D. Kato, A. Osakabe, H. Kurumizaka, H. Kono*,
"Structural Studies of Overlapping Dinucleosomes in Solution",
Biophysical Journal, 118 (2019) 2209-2219.
‡: equal contribution
doi.org/10.1016/j.bpj.2019.12.010
- M. Yagi-Utsumi, A. Sikdar, C. Song, J. Park, R. Inoue, H. Watanabe, R. N. Burton-Smith, T. Kozai, T. Suzuki, A. Kodama, K. Ishii, H. Yagi, T. Satoh, S. Uchiyama, T. Uchihashi, K. Joo, J. Lee, M. Sugiyama, K. Murata, K. Kato,
"Supramolecular tholos-like architecture constituted by archaeal proteins without functional annotation",
Scientific Reports, 6 (2020) 1540.
https://doi.org/10.1038/s41598-020-58371-2
- T. Saio, K. Ishimori,
"Accelerating structural life science by paramagnetic lanthanide probe methods",
Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1864 (2020) 129332.
doi.org/10.1016/j.bbagen.2019.03.018
- R. Inoue, T. Nakagawa, K. Morishima, N. Sato, A. Okuda, R. Urade, R. Yogo, S. Yanaka, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, K. Omoto, K. Ito, M. Sugiyama,
"Newly developed Laboratory-based Size exclusion chromatography Small-angle x-ray scattering System (La-SSS)",
Scientific Reports,9 (2019) 12610.
doi.org/10.1038/s41598-019-48911-w
- H. Nakagawa, M. Kataoka,
"How can we derive hydration water dynamics with incoherent neutron scattering and molecular dynamics simulation?",
Biophysics and Physicobiology, 16 (2019) 213-219.
doi.org/10.2142/biophysico.16.0_213
- H. Nakagawa, T. Oyama,
"Molecular Basis of Water Activity in Glycerol–Water Mixtures",
Frontiers in Chemistry - Physical Chemistry and Chemical Physics, 7 (2019) 731.
doi.org/10.3389/fchem.2019.00731
- H. Nakagawa, Y. Joti, A. Kitao, O. Yamamuro, M. Kataoka,
"Universality and structural implications of the Boson peak in proteins",
Biophysical Journal 117 (2019) 229-238.
doi.org/10.1016/j.bpj.2019.06.007
- N. Yamamoto, T. Akai, R. Inoue, M. Sugiyama, A. Tamura, E. Chatani,
"Structural Insights into the Inhibition of Amyloid Fibril Formation by Fibrinogen via Interaction with Prefibrillar Intermediates",
Biochemistry, 58(24) (2019) 2769-2781.
doi.org/10.1021/acs.biochem.9b00439
- S. Yanaka, R. Yogo, R. Inoue, M. Sugiyama, S. G. Itoh, H. Okumura, Y. Miyanoiri, H. Yagi, T. Satoh, T. Yamaguchi, K. Kato,
"Dynamic Views of the Fc Region of Immunoglobulin G Provided by Experimental and Computational Observations",
Antibodies, 8(3) (2019) 39.
doi.org/10.3390/antib8030039
-
S. Kawagoe, H. Nakagawa, H. Kumeta, K. Ishimori, T. Saio,
"Structural insight into proline cis/trans isomerization of unfolded proteins catalyzed by the trigger factor chaperone",
The Journal of Biological Chemistry, 293 (2018) 15095-15106.
doi.org/10.1074/jbc.RA118.003579
国際会議
- M. Sugiyama,
"Cross point between in-silico and in-solution - from view of one scattering experiment -",
International Workshop "Algorithms for integrative structural biology", March 2020, Grenoble, France, (Oral: Invited).
- M. Sugiyama,
"Solution structure of biomolecules - ensemble average and its decomposition -",
International Symposium, Hydrodynamic and thermodynamic analysis of biological macromolecules and their interactions HyThaBio 2020, January 2020, Grenoble, France, (Oral: Invited).
- T. Saio,
"Applications of paramagnetic lanthanide ions in NMR and ESR",
International IPR Seminar, Osaka, November 2019. (Oral: Invited)
- T. Saio,
"Structural and kinetic insights into molecular chaperones",
International Symposium on Protein Folding andMisfolding-relatedAggregation,Daejeon, Korea, October2019. (Oral: Invited)
- T. Saio,
"Structural and kinetic basis for functional modulation of a molecular chaperone",
8th Asia-Pacific NMR Symposium, Singapore, July 2019. (Oral: Invited)
- M. Yagi-Utsumi, S.G. Itoh, H. Okumura, K. Nishimura and K. Kato,
"NMR characterization of conformational transition of amyloid-β on ganglioside membrane",
Frontier Bioorganization Forum 2019, July 7, 2019 Seoul. (Oral, Invited).
- M. Yagi-Utsumi,
"Biophysicalcharacterization of environment-dependentbiomolecular assemblies",
ExCELLS visit talks, Taipei, June 2019. (Oral: Invited)
- T. Oda, A. Sekino, A. Murakami, R. Oi, M. Yoneyama, N. Kodera, T. Ando, T. Konuma, K. Sugase, T. Oroguchi, R. Inoue, M. Sugiyama, S. Ishino, Y. Ishino, M. Sato,
"The dynamic structure and function of intrinsically disordered region of Hef that is associated with a DNA repair",
3rd Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering (AOCNS 2019),
Kenting, Taiwan, November 16-21, 2019 (Oral: Invited)
- M. Sugiyama,
"Integrative approach to complex structure and system",
3rd Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering (AOCNS 2019),
Kenting, Taiwan, November 16-21, 2019 (Oral: Invited)
- N. Sato, R. Urade, M. Sugiyama,
"Small-angle scattering analysis of nanostructure of hydrated wheat protein assembly",
3rd Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering (AOCNS 2019),
Kenting, Taiwan, November 16-21, 2019 (Poster)
- H. Yagi, Y. Yunoki, K. Morishima, K. Ishii, R. Murakami, L. Porcar, A. Martel, R. Inoue, K. Terauchi, S. Uchiyama, M. Sugiyama, K. Kato,
"Structural characterization of the circadian clock protein complexes composed of KaiA, KaiB and KaiC by integrative structural approaches",
第3回 J-PARC国際シンポジウム「宇宙・物質・生命の起源を求めて」, 2019年9月26日, つくば (口頭, 招待)
- M. Sugiyama,
"Biological Small-Angle Neutron Scattering",
The 11th AONSA Neutron School 2019,
Daejeon, S. Korea, August 19-23, 2019 (Lecture: Invited)
- H. Nakagawa,
"Protein dynamics by NIS",
Mini-symposium: Dynamics of biomolecules and hydration water, and neutron scattering, July, 2018 (Oral, Invited)
- S. Yanaka, R. Yogo, R. Inoue, M. Sugiyama, S. G. Itoh, H. Okumura, Y. Miyanoiri, H. Yagi, T. Satoh, T. Yamaguchi and K. Kato,
"Dynamic Views of the Fc Portion of Immunoglobulin G Provided by Experimental and Computational Observations",
Frontier Bioorganization Forum 2019, July 7, 2019 Seoul. (Oral, Invited)
- T. Saio,
"Exploring conformational states of a protein enzyme using paramagnetic lanthanide ions",
Biometal Science 2019,
Sapporo, June 2019. (Oral: Invited)
- M. Sugiyama,
"Future Perspective of Laboratory-Based SAXS",
XVII International Small-Angle Scattering Conference (SAS2018),
Traverse City, Michigan, October 7-12, 2018 (Oral:Rigaku Lunch)
- R. Inoue, K. Morishima, N. Sato, M. Sugiyama, T. Nakagawa,
"Laboratory based SEC SAXS SYSTEM (La-SSS)",
XVII International Small-Angle Scattering Conference (SAS2018),
Traverse City, Michigan, October 7-12, 2018 (Poster)
国内学会発表
- 杉山正明
"溶液散乱"
第4回重水素材料研究会、 2019年 12月 , 東海 茨城(招待講演)
- 杉山正明
"高濃度に潜む蛋白質を見る―中性子溶液散乱の挑戦―"
第4回 LLPS研究会・ ASUKA若手交流会 2019, 2019年 12月 , 橿原(招待講演)
- 佐藤衛
"天然変性蛋白質の構造研究と LLPSの構造基盤構築への展望"
第4回 LLPS研究会・ ASUKA若手交流会 2019, 2019年 12月 , 橿原(招待講演)
- 齋尾智英
"低複雑性蛋白質の液 -液相分離の制御と破綻のメカニズム : NMRによる解析"
第4回 LLPS研究会・ ASUKA若手交流会 2019, 2019年 12月 , 橿原(招待講演)
- 杉山正明
"中性子散乱で探る溶液中の蛋白質の構造・ダイナミクス -in Cell SANSを目指して-"
第42回日本分子生物学会、 2019年 12月 , 福岡(招待講演)
- 矢木真穂
"アルツハイマー病の解明を目指した NMR構造研究"
東京大学社会連携講座:革新分子構造解析講座公開シンポジウム ―低分子からタンパク質まで,統合分子構造解析― , 東京 , 2019年 11月(口頭 , 招待)
- 中川洋
"中性子非弾性散乱・準弾性散乱と分子シミュレーションによる蛋白質ダイナミクスの解析"
CBI学会 2019年大会、セッション「創薬に貢献する中性子の現状と今後」 2019年 10月、東京 (口頭)
- M. Sugiyama
"SAXS/SANS hybrid approach"
PF workshop "Frontiers of the Intermolecular Interactions Analysis of Biomolecules promoted byBioSAS",Tsukuba, Japan, September 11-12, 2019 (Oral: Invited)
- 斉尾智英
"金属イオンを用いた SAXSと NMRによるマルチドメイン蛋白質の動的構造解析"
PF研究会「 BioSASが拓く生体高分子の分子間相互作用解析の最前線」 ,2019年 9月 , つくば(口頭 , 招待)
- 中川洋
"蛋白質構造の硬さ・柔らかさと水和水ダイナミクス "
ATI水和ナノ構造研究会 , 2019年 9月
- M. Yagi-Utsumi and K. Kato
"Biophysical characterization of environment-dependent protein assemblies of physiological and pathologicalinterest"
第57回日本生物物理学会年会 , 2019年 9月 , 宮崎(口頭)
- T. Oroguchi, M. Nakasako
"Domain motion of Fv-fragmentin antibodyimmunoglobulin G controls conformation of antigen-recognizing loop through hydration structure"
第57回日本生物物理学会年会 , 2019年 9月 , 宮崎(口頭)
- T. Oda, A. Sekino, A. Murakami, R. Oi, M. Yoneyama, N. Kodera, T. Ando, T. Konuma, K. Sugase, T. Oroguchi, S. Ishino, Y. Ishino, and M. Sato
"The structure and function of intrinsically disordered region of Hef that is associated with a DNA repair"
第57回日本生物物理学会年会 , 2019年 9月 , 宮崎(ポスター)
- H. Nakagawa, T. Saio, T. Oda, M. Sato, R. Inoue, M. Sugiyama, T. Tominaga, Y. Kawakita, "QENS of protein solutions measured by the TOF near Backscattering Spectrometer DNA"
J-PARCSymposium2019、 2019年 9月 (ポスター )
- 中川洋
"中性子準弾性散乱による蛋白質の拡散運動と構造揺らぎの解析 "
蛋白質研究所セミナー「液・液相分離の新たな展開へ向けて」、 2019年 9月、大阪 (口頭・招待講演)
- 杉山正明
"溶液散乱で探る生体高分子の構造とダイナミクス"
第20回若手 NMR研究会、 2019年 8月、蒲郡(招待講演)
- M. Sugiyama
"Neutron Scattering . tools for structure and dynamics for biomacromolecules in solution-"
The 13th Mini-Symposiumon Liquids MSL2019,Okayama, June, 2019 (Oral:Invited)
- 中川洋
"非干渉性中性子準弾性散乱による生体物質の相転移と分子運動性の解析 "
第2回 LLPS研究会、 2019年 4月、東京 (口頭・依頼発表)
- 杉山正明
"溶液散乱で見える生体高分子の構造"
バイオインタラクション研究会 第4回ワークショップ、 2019年 3月、京都(招待講演)
- M. Sugiyama
"Structural analysis of protein complex utilizing inverse contrast matching SANS"
J-PARC Workshop2018, Deuterium Labeling Study for Neutron Science, January 2019, Tokai, Ibaragi(Oral, invited)
- 杉山正明
"溶液散乱法を用いた生体高分子の構造・ダイナミクスの研究 "
2018年度第 2回水和ナノ構造研究会 , 2019年 1月 , 東京 (口頭 , 招待)
- 中川洋
"中性子散乱と計算科学の融合による蛋白質のドメインダイナミクスの解析"
大学蛋白質研究所セミナー、第 1回構造生命科学研究会、 2019年 1月、大阪 (口頭・招待講演)
- 中川洋, 斎尾智英、杉山正明、井上倫太郎、富永大輝
"中性子散乱と MDの相関構造解析による蛋白質の階層間連携ダイナミクス "
第18回日本中性子科学会年会 , 2018年 12月 , 水戸 (口頭)
- 杉山正明
"中性子溶液散乱を基軸とした蛋白質の構造・ダイナミクス解析への挑戦"
第 18回日本中性子科学会年会, 2018年 12月, 水戸 (口頭)
- 中川洋
"新世代中性子構造生物学の開拓"
,UserGroup Meeting onTOF near Backscattering Spectrometer DNA 2018、 2018年 10月 (口頭・依頼講演)
- 中川洋
"蛋白質結晶の分子シミュレーション~水素・水和構造と構造変化~ "
iBIX将来構想検討会 , 2018年 11月
- 守島健, 酒巻裕介, 井上倫太郎, 佐藤信浩, 裏出令子, 杉山正明
"重水素化支援中性子小角散乱と超遠心分析を協奏的に用いたα B-クリスタリンの構造と動態"
日本生物物理学会第 56回年会 , 2018年 9月 , 岡山 (ポスター)
- T. Oroguchi, M. Nakasako
"Domain motion of Fv-fragmentin anti-dansyl immunoglobulinG controls conformation of its flexible antigen-binding region"
第56回日本生物物理学会年会(岡山、 2018年 9月)
- 中川洋
"中性子分光法による生体物質のダイナミクス研究"
QST第 624回高崎研オープンセミナー「生体物質の機能に迫る!中性子と放射光で何が分かるのか」 , 2018年 9月
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小田 隆, 関野 絢子, 村上 綾香, 大井 里香, 米山 真紀, 古寺 哲幸, 安藤 敏夫, 小沼 剛, 菅瀬 謙治, 苙口 友隆, 井上 倫太郎, 杉山 正明, 石野 園子, 石野 良純, 佐藤 衛
"DNA修復にかかわるHefの天然変性領域の揺らいだ構造と機能"
第4回LLPS研究会・ASUKA若手交流会2019, 2019年12月, 橿原(ポスター)
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矢木真穂
"古細菌タンパク質の高次構造多型の解析"
2019年度第1回中性子構造生物学研究会, 2019年11月, 東京(口頭, 招待)
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M. Sugiyama
"SAXS/SANS hybrid approach"
PF workshop "Frontiers of the Intermolecular Interactions Analysis of Biomolecules promoted by BioSAS"
Tsukuba, Japan, September 11-12, 2019 (Oral: Invited)
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斉尾 智英
"金属イオンを用いたSAXSとNMRによるマルチドメインタンパク質の動的構造解析"
PF研究会「BioSASが拓く生体高分子の分子間相互作用解析の最前線」
2019年9月, つくば (口頭, 招待)
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中川洋
"タンパク質構造の硬さ・柔らかさと水和水ダイナミクス",
ATI水和ナノ構造研究会, 2019年9月
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T. Oda, A. Sekino, A. Murakami, R. Oi, M. Yoneyama, N. Kodera, T. Ando, T. Konuma, K. Sugase, T. Oroguchi, S. Ishino, Y. Ishino, and M. Sato
"The structure and function of intrinsically disordered region of Hef that is associated with a DNA repair"
日本生物物理学会年会, 2019年9月, 宮崎(ポスター)
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佐藤信浩, 裏出令子, 奥田綾, 守島健, 井上倫太郎, 杉山正明
"X線小角散乱を用いた大豆タンパク質の凝固にともなうナノ構造解析",
日本食品科学工学会第66回大会, 2019年8月, 札幌(口頭)
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斉尾 智英
"金属イオンを用いたSAXSとNMRによるマルチドメインタンパク質の動的構造解析"
PF研究会「BioSASが拓く生体高分子の分子間相互作用解析の最前線」, 2019年6月, つくば (口頭, Invited).
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T. Oda,
"Protein deuteration for small angle neutron scattering"
J-PARC Workshop2018 / Deuterium Labeling Study for Neutron Science
January 2019, Tokai, Ibaragi(Oral, invited)
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M. Sugiyama
"Structural analysis of protein complex utilizing inverse contrast matching SANS"
J-PARC Workshop2018, Deuterium Labeling Study for Neutron Science
January 2019, Tokai, Ibaragi(Oral, invited)
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杉山正明,
"溶液散乱法を用いた生体高分子の構造・ダイナミクスの研究"
2018年度 第2回水和ナノ構造研究会, 2019年1月, 東京(口頭, 招待)
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井上 倫太郎
"小角中性子散乱と分析超遠心によるα-クリスタリンのサブユニット動態"
PF研究会「多様な物質・生命科学研究に広がる小角散乱~多(他)分野の小角散乱を学ぼう!」
2018年12月, 水戸(口頭, 招待)
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小田 隆
"小角散乱と計算科学で明らかにする天然変性タンパク質の動的構造と機能"
PF研究会「多様な物質・生命科学研究に広がる小角散乱~多(他)分野の小角散乱を学ぼう!」
2018年12月, つくば(口頭, 招待)
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小田 隆
"SANSと計算科学による天然変性タンパク質の動的構造と機能の解明"
第18回日本中性子科学会年会, 2018年12月, 水戸(口頭)
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中川 洋
"中性子散乱とMDの相関構造解析による蛋白質の階層間連携ダイナミクス"
第18回日本中性子科学会年会, 2018年12月, 水戸(口頭)
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井上倫太郎
"準濃厚環境下におけるα-クリスタリンの動態"
第18回日本中性子科学会年会, 2018年12月, 水戸(口頭)
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杉山正明
"中性子溶液散乱を基軸とした蛋白質の構造・ダイナミクス解析への挑戦”
第18回日本中性子科学会年会, 2018年12月, 水戸(口頭)
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守島健
"解離会合平衡下にあるタンパク質会合体の構造解析"
第18回日本中性子科学会年会, 2018年12月, 水戸(ポスター)
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佐藤信浩
"小角散乱法による小麦タンパク質グリアジン/グルテニン複合体の構造解析"
第18回日本中性子科学会年会, 2018年12月, 水戸(ポスター)
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中川洋
"蛋白質結晶の分子シミュレーション~水素・水和構造と構造変化~"
iBIX将来構想検討会, 2018年11月
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守島健 酒巻裕介 井上倫太郎 佐藤信浩 裏出令子 杉山正明
"重水素化支援中性子小角散乱と超遠心分析を協奏的に用いたαB-クリスタリンの構造と動態"
日本生物物理学会第56回年会, 2018年9月, 岡山(ポスター)
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中川洋
"中性子分光法による生体物質のダイナミクス研究"
QST第624回高崎研オープンセミナー「生体物質の機能に迫る!中性子と放射光で何が分かるのか」, 2018年9月
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佐藤信浩
"X 線小角散乱でみるグリアジン水和凝集体のナノ構造:NaCl添加と脱アミド化の効果"
日本食品科学工学会 第65回大会 2018年8月, 仙台(口頭)