粒子線物性学研究室
(杉山研究室)
featuring
ナノ構造物理学
nano structural physics
with quantum beams
since 2011 May
-次世代の中性子生物学を目指して-
国際ワークショップ報告
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What's new
- Journal of Biochemistry誌に以下の論文が掲載されました。
N. Sato‡, R. Yogo‡, S. Yanaka, A. Martel, L. Porcar, K. Morishima, R. Inoue, T. Tominaga, T. Arimori, J. Takagi, M. Sugiyama, K. Kato,
"A feasibility study of inverse contrast-matching small-angle neutron scattering method combined with size exclusion chromatography using antibody interactions as model systems",
Journal of Biochemistry, 169, (2021) 701-708.
https://doi.org/10.1093/jb/mvab012 - 柚木康弘博士研究員が着任しました(2021/4/1)
- 金井きみよ事務補佐員が着任しました(2021/4/1)
- Biophysics and Physicobiology誌に以下の論文が掲載されました。
A. Okuda‡, R. Inoue‡, K. Morishima, T. Saio, Y. Yunoki, M. Yagi-Utsumi, H. Yagi, M. Shimizu,, N. Sato, R. Urade, K. Kato, M. Sugiyama, ‡equal contribution
"Deuteration Aiming for Neutron Scattering",
Biophysics and Physicobiology, 18 (2021) 16-27.
https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v18.003 - Scientific Reports誌に以下の論文が掲載されました。
A. Okuda, M. Shimizu, K. Morishima, R. Inoue, N. Sato, R. Urade, M. Sugiyama,
"Solution structure of multi-domain protein ER-60 studied by aggregation-free SAXS and coarse-grained-‑MD simulation",
Scientific Reports, 11 (2021) 5655.
https://doi.org/10.1038/s41598-021-85219-0 - 国立大学附置研究所・センター会議のWebサイトのインタビュー欄に杉山教授の記事が掲載されました (2021/3/5)
- Communications Biology誌に以下の論文が掲載されました。
R. Hirano, Y. Arimura, T. Kujirai, M. Shibata, A. Okuda, K. Morishima, R. Inoue, M. Sugiyama, H Kurumizaka,
"Histone variant H2A.B-H2B dimers are spontaneously exchanged with canonical H2A-H2B in the nucleosome",
Communications Biology, 4 (2021) 191.
https://doi.org/10.1038/s42003-021-01707-z
- 京都大学最新研究成果紹介 - 博士研究員の奥田綾さんが助教に就任しました(2021/2/1)
- Scientific Reports誌に以下の論文が掲載されました。
R. Inoue, Y. Sakamaki, T. Takata, K. Wood, K. Morishima, N. Sato, A. Okuda, M. Shimizu, R. Urade, N. Fujii, M. Sugiyama,
"Elucidation of the mechanism of subunit exchange in αB-crystallin oligomers", Scientific Reports, 11 (2021) 2555.
doi.org/10.1038/s41598-021-82250-z - Scientific Reports誌に以下の論文が掲載されました。
R. Inoue, T. Oda, H. Nakagawa, T. Tominaga, T. Saio, Y. Kawakita, M. Shimizu, A. Okuda, K. Morishima, N. Sato, R. Urade, M. Sato, M. Sugiyama,
"Dynamics of proteins with different molecular structures under solution condition",
Scientific Reports,10 (2020) 21678,
doi.org/10.1038/s41598-020-78311-4 - Communications Biology誌に以下の論文が掲載されました。
K. Morishima, A. Okuda, R. Inoue, N. Sato, Y. Miyamoto, R. Urade, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, R. Hirano, T. Kujirai, H. Kurumizaka, M. Sugiyama,
"Integral approach to biomacromolecular structure by analytical-ultracentrifugation and small-angle scattering",
Communications Biology, 3, (2020) 294.
doi.org/10.1038/s42003-020-1011-4
- 京都大学研究成果トピックス
- 日本経済新聞記事 - Journal of Biochemistry誌に以下の論文が掲載されました。
A. Okuda, M. Matsusaki, T. Masuda, K. Morishima, N. Sato, R. Inoue, M. Sugiyama, R. Urade,
“A novel soybean protein disulfide isomerase family protein possesses dithiol oxidation activity: Identification and characterization of GmPDIL6”
Journal of Biochemistry, doi.org/10.1093/jb/mvaa058 - 清水将裕博士研究員が着任しました(2020/4/1)
- ANSTO(Quokka)実験 (2019/12/11-16)
- PF研究会 (2019/9/11-12)
- AOCNS2019 at 台湾・墾丁 (2019/11/16-20)
- Dr. Nicolas De Souza講演会 (2019/10/17)
- Scientific Reports誌に以下の論文が掲載されました。
R.Inoue, T.Nakagawa, K.Morishima, N.Sato, A.Okuda, R.Urade, R.Yogo, S.Yanaka, M.Yagi-Utsumi, K.Kato, K.Omoto, K.Ito, M.Sugiyama
"Newly developed Laboratory-based Size exclusion chromatography Small-angle X-ray scattering System (La-SSS)",
Scientific Reports,9 (2019) 12610. - J-PARC Symposium 2019に参加しました(2019/9/23-9/26)
- Mariage of computational and experimental techniques for solution small-angle scattering (2019/9/13)
- 阪大内山研を訪問させていただきました(2019/8/19)
- クロマチン領域会議(2019/6/20-22)
- 蛋白質科学会（神戸）に参加しました (2019/6/24-26)
- NMR若手夏の学校@蒲郡 (2019/8/2-3)
- ANSTO (Quokka) 実験 (2019/7/22-26)
- NIST (NSE)実験 (2019/5/21-6/3)
- 北海道で学会(2019/8/29-9/2)
- J-PARC（TAIKAN）実験 (2019/7/3-4)
- 新世代中性子構造生物学 meeting＠神戸 (2019/6/25)
- 不二たん白質研究振興財団報告会 (2019/5/27-28)
- 大田ゆかり先生 講演会 (2019/5/8)
- 片岡先生講演会 (2019/4/19)
- M1の宮本洋佑君が配属されました(2019/4/1)
- 奥田綾博士研究員が着任しました(2019/4/1)
- 日本農芸化学会＠東京 (2019/3/24-27)
- バイオインタラクション研究会で講演しました (2019/3/14)
- 矢木先生、柚木さん来訪 (2019/3/4)
- ANSTO実験 (2019/2/25-28)
- 真穂先生＆メイさん登場 (2019/2/12-13)
- 新年会 (2019/1/7)
- ILLでの初実験(2018/10/18-23)
- 国際小角散乱会議 SAS2018, アメリカ、ミシガン (2018/10/7-12)
- 溶液タンパク質構造研究会 (2018/9/18)
- 日本食品科学工学会大会に参加しました (2018/8/22-24)
- ANSTO実験 (2018/7/27-30)
- Dr. Kathleenn Woodセミナー (2018/6/4) (2018/7/12)
- BMIAフォーラム (2018/8/7-8)
- ILL実験記 (2018/6/18-21)
- 「新世代中性子構造生物学」Kick off meeting (2018/7/12)
- ÄKTA pure 25納品 (2018/5/25)
- ローレンツ祭 (2018/5/18)
- FT-IR "朱雀" 導入 (2018/5/16)
- 歓迎！令子様 (2018/5/2)
- 佐藤宗太先生・長田裕也先生来室 (2018/4/25)
- 酒巻君追いコン (2018/3/23)
- 第8回日台X線・中性子散乱研究会 ＠国立中央大学(台北) (2018/3/14-18)
- 中川先生講演会 (2018/3/5)
- ORNL実験 (2018/2/23-26)
- 裏出令子特任教授が着任しました(2018/4/1)
- 所属組織の名称が「京都大学原子炉実験所」から「京都大学複合原子力科学研究所」に変わりました(2018/4/1)
- Jouranl of the American Chemical Society誌に以下の論文が掲載されました（本学によるプレスリリース）。
Y.Nagata*, T.Nishikawa, M.Suginome*, S.Sato, M.Sugiyama*, L.Porcar, A.Martel, R.Inoue, and N.Sato, "Elucidating the Solvent Effect on the Switch of the Helicity of Poly(quinoxaline-2,3-diyl)s: A Conformational Analysis by Small-Angle Neutron Scattering", Journal of the American Chemical Society (2018) in press. DOI:10.1021/jacs.7b11626
- 修士論文発表会 (2018/2/5-6)
- 2018年新年会 (2018/1/4)
- AUC workshop in 北京（2017/9/25-29）
- 3月に開催された国際ワークショップ "Neutron Biology for Next Generation" (-次世代の中性子生物学を目指して-) の報告書が完成しました。PDF版のダウンロードはこちら。印刷版をご希望の方は杉山までご連絡ください
- Biochemistry and Biophysics Reports誌に以下の論文が掲載されました。
R. Yogo, S. Yanaka, H. Yagi, A. Martel, L. Porcar, Y. Ueki, R. Inoue, N. Sato, M. Sugiyama*, and K. Kato*, "Characterization of conformational deformation-coupled interaction between immunoglobulin G1 Fc glycoprotein and a low-affinity Fcγ receptor by deuteration-assisted small-angle neutron scattering", Biochemistry and Biophysics Reports, in press.
- 守島さん歓迎会 (2017/7/21)
- ローレンツ祭2017 (2017/5/19)
- 新学術領域「動的秩序と機能」全体班会議 (2017/6/2-5)
- 守島健助教が着任しました(2017/6/1)
- 胡桃坂研御一行来室 (2017/5/29-30)
- 新見先生ご講演会 (2017/5/17)
- 不二たん白質研究振興財団成果報告会 (2017/5/29-30)
- ANSTO実験記 (2017/5/22-26)
- Neutron Biology for Next Generation (2017/3/22-23)
- Okazaki Conferenceに参加してきました (2017/3/19-20)
- 大場洋次郎助教が日本原子力研究開発機構に転出されました(2017/4/1)
- Neutron Biology for Next Generation (2017/3/22-23)
- Okazaki Conferenceに参加してきました(2017/3/19-20)
- 初体験：SEC-SAXS (2017/02/26-27)
- 中川洋博士来室(2017/2/2-3)
- ICMAGMA-2017に参加しました(2017/1/31-2/3)
- Scientific Reports誌に以下の論文が掲載されました。
M. Sugiyama, H. Yagi, K. Ishii, L. Porcar, A. Martel, K. Oyama, M. Noda, Y. Yunoki, R. Murakami, R. Inoue, N. Sato, Y. Oba, K. Terauchi, S. Uchiyama, and K. Kato, "Structural characterization of the circadian clock protein complex composed of KaiB and KaiC by inverse contrast-matching small-angle neutron scattering", Scientific Reports, 6, (2016) 35567.
- 高田さん壮行会！(2016/10/7)
- 東京農工大 養王田正文先生ご来訪 (2016/9/16)
- Journal of Applied Crystallography誌に以下の論文が掲載されました。
Y. Oba, S. Morooka, K. Ohishi, N. Sato, R. Inoue, N. Adachi, J. Suzuki, T. Tsuchiyama, E. Gilbert, and M. Sugiyama," Magnetic scattering in the simultaneous measurement of small-angle neutron scattering and Bragg-edge from steel",Journal of Applied Crystallography, 49 (2016) 1659.
- sans-u駆動試験 (2016/9/5-6)
- Dr. Porcar（Institut Laue Langevin）来室！(2016/8/13-14)
- ILL実験記(2016/7/4-20)
- 胡桃坂先生（早稲田大学）ご来所！(2016/6/28-29)
- ANSTO実験記(2016/6/3-6, 21-24)
- Scientific Reports誌に以下の論文が掲載されました。
R. Inoue, T. Takata, N. Fujii, K. Ishii, S. Uchiyama, N. Sato, Y. Oba, K. Wood, K. Kato, N. Fujii, and M. Sugiyama, "New insight into the dynamical system of αB-crystallin oligomers", Scientific Reports, 6 (2016) 29208.
- オーストリアで開催されたTHERMEC2016に参加しました。(2016/5/29-6/3)
- Instrumentsページを更新しました。(2016/4/25)
- 2016年4月から、髙田咲枝さん（技術補佐員）と酒巻裕介さん（大学院生・理学研究科修士課程）がメンバーに加わりました。(2016/4/1)
- 第7回日台中性子X線散乱研究会を運営しました(2016/3/10-13)
- SAXSが導入されました(2016/2/26)
- ハワイ島コナで開かれた国際水晶体学会 ICL2015 に参加しました(2015/12/6-11)
- ISIJ International誌に以下の論文が掲載されました。
Y. Oba, S. Morooka, H. Sato, N. Sato, K. Ohishi, J. Suzuki, and M. Sugiyama, "Simultaneous characterisation of precipitates and matrix in a steel using small-angle neutron scattering and Bragg-edge transmission analysis", ISIJ International, 55 (2015) 2618-2623.
- フランスILLで実験 (2015/11/29-12/5)
- オーストラリアANSTOでSANS測定 (2015/10/23-11/1)
- Journal of Agricultural and Food Chemistry誌に以下の論文が掲載されました。
N. Sato, A. Matsumiya, Y. Higashino, S. Funaki, Y. Kitao, Y. Oba, R. Inoue, F. Arisaka, M. Sugiyama, and R. Urade, "Molecular assembly of wheat gliadins into nanostructures: A small-angle X-ray scattering study of gliadins in distilled water over a wide concentration range", Journal of Agricultural and Food Chemistry,63 (2015) 8715–8721.
- 上久保先生講演会(2015/09/25)
- Biochemistry and Biophysics Reports誌に以下の論文が掲載されました。
M. Sugiyama, N. Horikoshi, Y. Suzuki, H. Taguchi, T. Kujirai, R. Inoue, Y. Oba, N. Sato, A. Martel, L. Porcar, and H. Kurumizaka, "Solution structure of variant H2A.Z.1 nucleosome investigated by small-angle X-ray and neutron scatterings", Biochemistry and Biophysics Reports, 4, (2015) 28-32.
- ドイツ・ベルリンで開催された小角散乱の国際会議SAS2015に参加しました(2015/09/13-18)
- ILL again!(2015/07/24-27)
- AOCNS-2015に参加しました(2015/07/19-22)
- ANSTO SANXS実験 (2015/05/30-06/03)
- 高エネ研 Photon FactoryでSAXSの測定を行いました (2015/05/16-17)
- ローレンツ祭に参加しました (2015/05/15)
- JST-ERATO彌田超集積材料プロジェクト主催のミニシンポジウム「中性子溶液散乱によるタンパク質の静的・動的構造解析」にて杉山教授・井上准教授が招待講演をしました (2015/04/21-22)
- 日野先生「中性子科学会技術賞」受賞お祝い会兼恒例夜桜鑑賞会(通称「夜桜お七会」) (2015/04/06)
- 国際ワークショップ「The 8th Meeting on Collective Action for Nomadic Small Angle Scatterers:canSAS-VIII」に杉山教授と大場助教が参加し、大場助教が2件のポスター発表を行いました(2015/4/14-16)
・講演タイトル 「Recent Activity of KUMASANS」 「Transmission Analysis in Time-of-Flight Small-Angle Neutron Scattering」 - 第3回Neutrons in Biology Japan研究会にて杉山教授が口頭講演を行いました（2015/3/31）
・講演タイトル「Biological SANS for next stage」- 日本化学会の特別シンポジウム「中性子線が拓く化学の未来」にて杉山教授が口頭講演を行いました。（2015/3/29）
・講演タイトル「中性子小角散乱の基礎と応用」- J-PARCで機能性材料の構造研究のための実験を行いました(2015/3/21-24)
- 第3回物構研サイエンスフェスタ・第6回MLFシンポジウムで井上准教授・杉山教授が口頭講演を行いました(2015/3/17.18)
・井上講演タイトル「準弾性中性子散乱による共架橋ゴムのダイナミクス解析」(T)
・杉山講演タイトル「中性子の中性子による中性子のための生物溶液散乱」(T)- 第6回中性子小角散乱解析法研究会を主催しました。また、大場助教が口頭講演を行いました。(2015/3/2)
・講演タイトル「京大炉中性子小角散乱装置KUR-SANSにおける鉄鋼材料測定」- ORNLで実験しました (2014/11/25-28)
- ANSTOで実験してきました（2014/11/24-12/6）
- 杉山正明教授 生誕五十年祭を大々的に挙行（2014/11/21）
- Photon Factoryで裏出研のみなさんと実験（2014/11/8-9）
- ILLで実験しました（2014/10/5-11）
- Journal of Physics D: Applied Physicsに以下の論文が掲載されました。
Y. Oba, S. Abe, M. Ohnuma, N. Sato, and M. Sugiyama,
"Temperature dependence of the nanostructure in a PbSe–ZnSe composite thin film",
J. Phys. D: Appl. Phys., 47, (2014) 435102/1-6.
- NISTで実験してきました！（2014/9/7-12）
- 井上倫太郎准教授がパパになりました！(2014/8/7)
- 井上倫太郎准教授が高分子学会の高分子研究奨励賞を受賞しました。(2014/5/29)
- オークリッジ国立研究所で中性子小角散乱実験をしました（2014/5/20-5/23）
- Biophysical Journalに以下の論文が掲載されました。
M. Sugiyama, Y. Arimura, K. Shirayama, R. Fujita, Y. Oba, N. Sato, R. Inoue, T. Oda, M. Sato, R. K. Heenan, and H. Kurumizaka,
"Distinct features of the histone core structure in nucleosomes containing the histone H2A.B variant",
Biophysical Journal, 106, (2014) 2206-2213.- 井上倫太郎准教授が着任しました。(2014/4/1)
Information
- 国立大学附置研究所・センター会議のWebサイトのインタビュー欄に杉山教授の記事が掲載されました (2021/3/5)
- Deuteration Aiming for Neutron Scattering (DANS)―中性子散乱のための重水素化マニュアル―を公開しました（2020/3/17）
- 科学研究費基盤研究S 「新世代中性子構造生物学の開拓」のホームページを開設しました
About us
それは、その物質が機能発現のために特定の構造を形成し、その構造に基づき運動をしているからです。
我々は、その構造を作る原理、その運動を引き起こす原理を知りたいと考えています。そこで、多くの物質の機能発現の場であるナノスケールに注目し、ナノスケールで形成される物質の興味深い構造や運動を解明すること、更には、興味深い物性を持つ物質の創製までを目指して、様々な物質を対象とした研究プロジェクトを走らせています。そして、物質の静的・動的構造を通して、一見無関係と思われる物質間に共通する構造と機能の相関をもたらすより深い真理迫りたいと思っています。加えて、ナノスケールの静的・動的構造を知るための測定手法・解析手法に注目しており、J-PARCやKURでの装置開発やRMC・MDなどのSimulationを用いた解析手法の開発も行っており、粒子線を用いたナノ構造解析センターも目指しています。
生物の根源であるタンパク質の精緻な構造形成の秘密を解き明かしたい方、高機能高分子のゲルの構造発現の理由を知りたい方、次世代のエネルギーとなり得る水素電池の開発を行いたい方、これらの物質に共通する深遠な構造形成の原理を知りたい方 ぜひ一度ご連絡ください。
また、実験は、国内外の原子炉・加速器中性子源(京都大学複合原子力科学研究所・J-PARC・JRR3、ILL・ISIS・PSI・LANSCEなど)やシンクロトロン放射光施設(SPring8・KEK-PFなど)に設置された分光器を用いて行っています。旅行好きの方も大歓迎です。
take over the world
